Hoàng tự phi Kiko tên thật là Kawashima Kiko (川島 紀子), sinh ngày 11 tháng 9 năm 1966 tại bệnh viện Shizuoka Saiseikai, khu Suruga, thành phố Shizuoka, Nhật Bản. Kiko là con gái đầu của ông Kawashima Tatsuhiko (川嶋 辰彥), giáo sư kinh tế học tại Đại học Gakushuin và mẹ là bà Sugimoto Kazuyo (杉本 和代). Ông nội của Hoàng tự phi là Kawashima Takahiko (川嶋 孝彦), cục trưởng cục Thống kê trong Nội các Nhật Bản và bà nội là Kawashima Itoko (川嶋紀子), con gái ông Ikegami Shirou, thị trưởng Osaka, tốt nghiệp trường trung học Shimizudani ở Osaka năm 1923. Hai ông bà kết hôn năm 1927.

Cả gia đình Kiko chuyển tới Pennsylvania, Mỹ năm 1967 khi cha cô theo học tại Đại học Pennsylvania và Kiko có 6 năm đầu đời tại đây. Kiko đã học tại nhà trẻ Jiyu Gakuen Yoji Seikatsudan thuộc hệ thống trường của Tập đoàn Jiyu Gakuen ở Nhật Bản.

Tháng 9 năm 1969, Kiko bắt đầu học mầm non tại trường Rosemont Trinity School ở Philadelphia, Mỹ. Một năm sau, cô học mẫu giáo tại trường mầm non Saint Mary cùng bang. Tháng 9 năm 1971 vào học trường tiểu học Henry C. Lea School.

Tháng 1973, năm Chiêu Hòa thứ 48, cha cô nhận chức phó giáo sư tại Đại học Gakushuin nên gia đình quay về tỉnh Shizouka, Nhật Bản. Tháng 9 năm đó, Kiko vào học trường tiểu học Shizuoka-shiritsu Nakada, phường Nakada, khu Surugaku, Shizuoka.

Tháng 9 năm 1975, cha cô đưa gia đình chuyển lên Tokyo nên Kiko vào học lớp 3 trường tiểu học Mejiro, Toshima, Tokyo gần với cơ quan của cha.

Năm 1976, Kiko được chuyển sang trường tiểu học Gakushuin (学習院初等科) với môi trường giáo dục tốt hơn. Tuy nhiên cuối học kỳ một năm đó, cha cô được mời làm nghiên cứu cấp cao tại Viện Quốc tế về Phân tích Hệ thống Ứng dụng, Laxenburg ở ngoại ô thủ đô Viên. Kiko đã dành thời gian 2 năm tại đây.

Năm 1977, Kiko học lớp 6 tại trường quốc tế American International School tại Vienna, Áo và trau dồi tiếng Anh. Do Áo sử dụng tiếng Đức làm ngôn ngữ chính nên Kiko cũng trau dồi ngôn ngữ này và dần bớt khó khăn khi sử dụng nó trong giao tiếp.[2]

Tháng 9 năm 1979, Kiko theo gia đình trở về Nhật Bản. Kiko theo học cấp 2 và cấp 3 tại trường trung học nữ Gakushuin (学習院女子中等科).

Năm 1985, Kiko ghi danh vào khoa tâm lý của Đại học Gakushuin (学習院大学). Tại hiệu sách trong trường, cô gặp gỡ tiền bối cùng trường là hoàng tử Fumihito, con trai thứ của Nhật hoàng Akihito. Sau đó, cả hai phát triển mối quan hệ sâu sắc qua các hoạt động trong trường.

Ngày 26 tháng 6 năm 1986, Kiko nhận được lời cầu hôn từ Fumihito nhưng ngay lập tức không nhận lời.[3]

Năm 1989, Kiko tốt nghiệp Đại học Gakushuin chuyên ngành Tâm lý học và tốt nghiệp Thạc sĩ cùng ngành tại đây năm 1995. Năm 2013, bà tốt nghiệp Tiến sĩ tại trường Đại học Ochanomizu (お茶の水女子大学).[4]